紫外線消毒器存在的缺點

(1) 無持續殺菌能力，消毒后的水如果遇到新的污染源，會再次被污染，需與氯配合使用；

(2) 濁度及水中懸浮物對紫外殺菌有較大影響，降低消毒效果；

(3) 紫外燈套管容易結垢，影響紫外光的透出和殺菌效果，因此需要對套管進行定期的清洗以及采取表面降溫措施來防止管垢的形成；

(4) 細菌的復活現象，一些細菌被紫外照射失活的病毒細菌可通過光的協助修復自身被破壞的組織，達到復活目的，另外一些細菌可能存在著暗復活現象(無需光照)；

(5) 國內使用經驗少，在國內，雖然工程上已經逐漸開始使用紫外線系統，但是對于紫外線消毒技術的研究并沒有開展起來，對于紫外線消毒的應用也還存在較多問題。